小智与皮卡丘在密阿雷市的棱镜塔前握紧了拳头，刚刚结束的道馆赛里，呱呱泡蛙的水之波动与希特隆的电电鼠的十万伏特碰撞出的虹光还未从众人视野里消散——这是小智在卡洛斯地区拿下的第二枚道馆徽章，也是他与伙伴们结伴同行的第32天。星海站在赛场边缘的梧桐树下，指尖轻轻拂过精灵球表面，红色暴鲤龙的精灵球正微微发烫，方才战斗中暴鲤龙主动从球里探出半个脑袋，用低沉的龙吟为皮卡丘鼓劲的模样，让她忍不住弯了弯嘴角。
“小智，你的战斗思路又精进了。”星海走上前，将一瓶冰镇的树果饮料递给气喘吁吁的小智，“最后让呱呱泡蛙用烟雾掩护，再趁机释放水流喷射，刚好克制了电电鼠的速度优势，这个判断很准。”她的语气总是带着博士特有的冷静，却又藏着朋友间的真诚。
小智挠着头哈哈大笑，皮卡丘也蹭了蹭他的脸颊：“嘿嘿，其实是刚才看到暴鲤龙好像在为我们加油，才突然想到的！对了星海，你之前说要去百刻市的古代遗迹调查‘卡洛斯巨石’的能量波动，什么时候出发呀？”
“明天一早。”星海打开平板电脑，调出遗迹的三维模型，“希特隆帮我改装的探测仪已经调试好了，莎莉娜，你确定要和我一起去吗？遗迹里可能会有野生宝可梦突袭，不像露营那么轻松哦。”
莎莉娜整理了一下裙摆，坚定地举起手中的宝可梦图鉴：“当然啦！我不仅要帮你记录数据，还要看看古代宝可梦的壁画呢，说不定能找到新的时尚灵感！”
当晚的露营地，篝火噼啪作响。希特隆正在给咚咚鼠检查能量背包，柚丽嘉抱着小软尾猴追着萤火虫跑，星海则坐在帐篷边，用特制的能量检测仪扫描裂空座的精灵球——自从在丰缘地区与裂空座达成共生契约后，她总会定期监测它的能量状态，避免其因远古基因苏醒而失控。小智凑过来，看着屏幕上跳动的蓝色波纹：“裂空座最近还好吗？上次它帮我们驱散乌云的时候，那股力量真的好厉害！”
“很稳定。”星海关掉检测仪，将精灵球放回背包，“它现在更愿意待在球里休养，不过如果遇到危及生态的危机，它还是会主动现身的。对了小智，百刻市附近有一座‘流星瀑布’，传说那里的水流能增强宝可梦的特殊攻击，你要不要和我们顺路去看看？你的皮卡丘和呱呱泡蛙，或许能在那里找到新的突破。”
小智眼睛一亮，立刻举起皮卡丘：“真的吗？那太好啦！我们明天一起出发吧！”
然而没人知道，此刻在百刻市的遗迹深处，一双紫色的眼睛正透过巨石的缝隙注视着远方——卡洛斯地区的“弗拉达利研究所”早已盯上了星海手中的探测仪，他们想要利用古代巨石的能量，唤醒沉睡的“哲尔尼亚斯”，而星海的研究数据，正是他们计划中最关键的一环。一场围绕着科学与野心的较量，即将在卡洛斯的森林与遗迹中拉开序幕。
第二天清晨，一行人沿着10号道路向百刻市出发。道路两侧的梧桐树高耸入云，阳光透过树叶的缝隙洒下，在地面形成斑驳的光点。莎莉娜一边走一边用图鉴记录路边的野生宝可梦，柚丽嘉则抱着小软尾猴，时不时伸手去够树枝上的甜甜蜜果。
“你们看！前面就是流星瀑布的入口了！”希特隆突然停下脚步，指着前方一道银白色的水流——瀑布从几十米高的悬崖上倾泻而下，落入下方的深潭，水雾在阳光的照射下形成了一道小小的彩虹。小智立刻拉着皮卡丘跑了过去，呱呱泡蛙也兴奋地跳到大石头上，对着瀑布挥舞着爪子。
“这里的水含有特殊的微量元素，对宝可梦的特攻提升很有帮助。”星海打开探测仪，屏幕上立刻跳出一串绿色的数据，“小智，你可以让皮卡丘和呱呱泡蛙在潭里练习技能，我去附近采集水样，马上回来。”说完，她便带着沙奈朵向瀑布上游走去——沙奈朵的超能力可以感知周围的能量场，能帮她避开隐藏的危险。
可就在星海采集水样时，探测仪突然发出刺耳的警报声。屏幕上的红色光点迅速向她靠近，沙奈朵立刻挡在她身前，双手凝聚出粉色的超能力护盾。下一秒，三只野生的尖牙陆鲨从岩石后面窜了出来，它们的眼睛泛着凶光，显然是将星海当成了入侵领地的敌人。
“尖牙陆鲨，地面与龙属性宝可梦，性格暴躁，会主动攻击靠近巢穴的人类。”星海快速调出图鉴，大脑飞速运转，“沙奈朵，不要用攻击技能，先用‘瞬间移动’带我到高处，它们的速度在平地上太快了！”
沙奈朵点点头，周身泛起粉色的光芒，带着星海瞬间移动到一棵大树的枝干上。可尖牙陆鲨并不罢休，其中一只猛地跳起，用“龙爪”抓向树干，树干瞬间被抓出三道深深的划痕。星海皱起眉头，她知道野生宝可梦攻击人类，往往是因为巢穴受到了威胁——她低头看向地面，发现潭边的岩石上有一个小小的洞穴，洞穴里放着几颗白色的蛋，显然是尖牙陆鲨的蛋。
“原来如此，它们是在保护自己的孩子。”星海松了口气，从背包里拿出几颗“神奇糖果”，这是她特意为野生宝可梦准备的。她让沙奈朵用超能力将糖果送到尖牙陆鲨面前，轻声说道：“对不起，我们不是来伤害你们的，只是想采集一些水样。这些糖果送给你们，希望你们能原谅我们的打扰。”
尖牙陆鲨们警惕地看着糖果，其中一只小心翼翼地凑过去，闻了闻后叼起糖果咽了下去。很快，它们的眼神变得温和起来，领头的尖牙陆鲨对着星海点了点头，然后带着同伴们退回了洞穴。星海松了口气，刚想从树上下来，却发现探测仪的屏幕突然黑了——刚才尖牙陆鲨的攻击波及到了探测仪，仪器内部的线路似乎被损坏了。
“糟了，探测仪坏了，这样就没办法去遗迹调查了。”星海有些沮丧，沙奈朵轻轻拍了拍她的肩膀，试图安慰她。就在这时，小智的声音从远处传来：“星海！你没事吧？刚才听到警报声，我们就赶过来了！”
小智和伙伴们跑了过来，看到星海没事，都松了口气。希特隆接过损坏的探测仪，仔细检查了一番后，眼睛一亮：“放心吧！我可以修好它！我带的工具箱里有备用的线路和芯片，只要给我半小时，保证能让它恢复正常！”
希特隆立刻坐在地上，拿出工具箱开始修理探测仪。小智则带着皮卡丘和呱呱泡蛙在潭里练习技能——皮卡丘的“十万伏特”在水流的加持下，电流变得更加粗壮，甚至在水面上形成了一道小小的电网；呱呱泡蛙的“水炮”也变得更有力量，水花溅起的高度比之前高了一倍。莎莉娜则帮星海整理采集到的水样，柚丽嘉则在一旁给尖牙陆鲨的蛋盖上柔软的树叶。
半小时后，希特隆举起探测仪，屏幕上重新亮起了绿色的光芒：“搞定！我还顺便给它加了一层防冲击的保护壳，下次再遇到攻击也不怕啦！”
星海接过探测仪，感激地看着希特隆：“太谢谢你了，希特隆。现在我们可以去遗迹了，不过天黑之前必须离开，遗迹里的磁场会在夜晚变得不稳定，可能会影响探测仪的准确性。”
一行人收拾好东西，向着百刻市的古代遗迹出发。夕阳西下，金色的余晖洒在遗迹的石墙上，给古老的建筑镀上了一层温暖的光芒。可谁也没有注意到，在他们身后的树林里，一个穿着黑色外套的男人正举着望远镜，将他们的一举一动都记录了下来——他正是弗拉达利研究所的研究员，代号“夜影”。
第二天一早，星海提议先去流星瀑布进行特训，再前往遗迹调查。小智自然举双手赞成，他早就想让皮卡丘和呱呱泡蛙变得更强了。
流星瀑布的深潭边，小智站在一块巨大的岩石上，对着皮卡丘喊道：“皮卡丘，准备好啦！我们今天要练习‘十万伏特’的精准控制！你试试只攻击潭里的水泡，不要打到周围的石头，明白吗？”
皮卡丘点点头，周身泛起黄色的电流，可当它释放“十万伏特”时，电流还是不受控制地扩散开来，不仅击碎了水泡，还打到了旁边的岩石上，溅起一片水花。皮卡丘有些沮丧地低下头，小智走过去摸了摸它的脑袋：“没关系，第一次都会这样！我们再来一次，这次集中注意力，把电流凝聚在一点上！”
星海坐在不远处的石头上，用探测仪监测着皮卡丘的能量波动。屏幕上显示，皮卡丘的电流能量很充足，但在释放时会出现短暂的紊乱，这是因为它还没有完全掌握能量的收放技巧。星海思考了一会儿，对小智说道：“小智，你可以让皮卡丘先练习‘电光一闪’，在移动中感受能量的流动。流星瀑布的水流能增强宝可梦的特攻，同时也能让它们的能量变得更稳定，或许在移动中，皮卡丘能找到控制电流的诀窍。”
小智眼前一亮，立刻采纳了星海的建议：“好主意！皮卡丘，我们先练习‘电光一闪’，绕着潭边跑，尽量靠近水流，感受水的力量！”
皮卡丘立刻行动起来，它的身影在潭边快速移动，黄色的闪电在它身后留下一道残影。随着跑动，皮卡丘渐渐感受到水流中传来的温和能量，这股能量像一只温柔的手，轻轻梳理着它体内紊乱的电流。当皮卡丘再次停下时，它对着小智点了点头，眼神里充满了自信。
“就是现在！皮卡丘，使用‘十万伏特’！”小智大喊道。
皮卡丘深吸一口气，周身的电流不再像之前那样狂暴，而是凝聚成一道细细的黄色光束，精准地击中了潭里的水泡。水泡瞬间被击碎，周围的石头却完好无损。小智兴奋地跳了起来：“成功啦！皮卡丘，你做到了！”
就在这时，星海的探测仪突然发出强烈的警报声，屏幕上的蓝色波纹变成了刺眼的红色。她立刻站起来，看向瀑布的上游：“不好，那里有一股强烈的能量波动，而且正在快速向我们靠近！”
话音刚落，瀑布上游突然传来一声巨响，一道黑色的影子从水里窜了出来，落在潭边的岩石上。众人仔细一看，原来是一只巨大的暴鲤龙，它的鳞片是深黑色的，眼睛泛着紫色的光芒，显然是被某种力量控制了。
“那是……被控制的暴鲤龙！”星海的瞳孔微微收缩，她立刻拿出平板电脑，快速搜索相关资料，“根据资料，弗拉达利研究所最近在秘密进行‘宝可梦控制实验’，他们会用特制的芯片植入宝可梦体内，控制宝可梦的意识，让它们成为攻击工具！”
黑色暴鲤龙对着众人咆哮一声，然后释放出“水炮”，巨大的水流向着小智和皮卡丘袭来。小智立刻喊道：“皮卡丘，用‘电网’挡住！呱呱泡蛙，使用‘烟雾’掩护！”
皮卡丘迅速释放出电网，挡住了水炮的攻击，呱呱泡蛙则吐出烟雾，将黑色暴鲤龙笼罩在其中。星海趁机对沙奈朵说道：“沙奈朵，用‘超能力’探测暴鲤龙体内的芯片位置！一定要快，它的能量很强，烟雾掩护撑不了多久！”
沙奈朵闭上眼睛，周身泛起粉色的光芒。很快，它对着星海点了点头，然后用超能力指向黑色暴鲤龙的颈部——那里有一个小小的黑色芯片，正散发着紫色的光芒。
“找到了！芯片在它的颈部！”星海大声喊道，“小智，你能不能让皮卡丘用‘铁尾’打掉芯片？只要破坏芯片，暴鲤龙就能恢复意识了！”
小智立刻点头：“交给我们吧！皮卡丘，跳起来，用‘铁尾’攻击它的颈部！”
皮卡丘纵身一跃，尾巴变得坚硬如铁，对着黑色暴鲤龙的颈部狠狠砸去。只听“咔嚓”一声，芯片被击碎，黑色暴鲤龙的身体晃了晃，眼睛里的紫色光芒渐渐消失，鳞片也恢复了正常的蓝色。它对着众人点了点头，然后转身跳入潭中，消失在瀑布深处。
星海松了口气，收起探测仪：“还好及时破坏了芯片，不然后果不堪设想。看来弗拉达利研究所已经开始行动了，我们必须加快调查遗迹的速度，不能让他们得逞。”
小智握紧了拳头：“放心吧，星海！我们会帮你的！不管是什么坏人，我和皮卡丘都不会让他们伤害宝可梦的！”
夕阳西下，一行人收拾好东西，向着百刻市的古代遗迹出发。他们知道，一场更严峻的挑战正在等待着他们。
经过一天的赶路，小智一行人终于到达了百刻市的古代遗迹。遗迹的入口被巨大的石门挡住，石门上刻着复杂的图案——有展翅飞翔的宝可梦，有光芒四射的巨石，还有手持法杖的古代人。
“这就是卡洛斯巨石的图案吗？”莎莉娜凑上前，仔细观察着石门上的图案，“看起来好神秘啊，这些古代人好像在举行什么仪式。”
星海打开探测仪，将石门的图案扫描进平板电脑：“根据资料，这些图案记录的是古代卡洛斯人祭祀哲尔尼亚斯的仪式。哲尔尼亚斯是传说中的生命宝可梦，它能赋予万物生命，而卡洛斯巨石则是它力量的载体。如果弗拉达利研究所想要唤醒哲尔尼亚斯，就必须利用巨石的能量。”
希特隆绕着石门转了一圈，然后蹲下身，检查石门底部的机关：“这扇石门应该有机关才能打开，我看看……这里有一个凹槽，形状好像和某种宝可梦的能量波动吻合。”
星海立刻明白了：“是沙奈朵！古代卡洛斯人认为超能力属性的宝可梦能与巨石沟通，沙奈朵的超能力或许能激活机关！”她对着沙奈朵点了点头，“沙奈朵，用‘超能力’注入凹槽，注意控制力量，不要破坏石门。”
沙奈朵走到石门边，双手对准凹槽，粉色的超能力缓缓注入。随着超能力的注入，凹槽里泛起金色的光芒，石门开始缓缓打开，发出“轰隆隆”的响声。石门后面是一条长长的通道，通道两侧的墙壁上刻着更多的壁画，壁画上记录着哲尔尼亚斯与卡洛斯地区的历史——它曾在卡洛斯地区陷入危机时现身，用生命能量拯救了万物，然后化作一颗种子，沉睡在巨石之下。
“原来哲尔尼亚斯已经沉睡了这么久。”莎莉娜感慨道，“弗拉达利研究所为什么要唤醒它呢？难道他们不知道这样会破坏卡洛斯的生态平衡吗？”
“他们只在乎力量。”星海的眼神变得严肃起来，“哲尔尼亚斯的生命能量非常强大，如果被他们利用，不仅会让哲尔尼亚斯陷入危险，还会让整个卡洛斯地区的宝可梦失去平衡。我们必须阻止他们。”
一行人沿着通道往前走，很快就来到了遗迹的核心区域——这里有一块巨大的石头，石头散发着淡淡的绿色光芒，正是他们要找的卡洛斯巨石。巨石周围有四个小小的石柱，石柱上刻着不同属性的符号，分别是火、水、草、电。
星海打开探测仪，开始扫描巨石的能量波动：“能量很稳定，看来哲尔尼亚斯还在沉睡。不过探测仪显示，最近有一股陌生的能量入侵过这里，应该是弗拉达利研究所的人来过。”
就在这时，通道里突然传来脚步声，众人立刻警惕起来。只见五个穿着黑色外套的人走了进来，为首的人戴着一副墨镜，手里拿着一个黑色的仪器——正是弗拉达利研究所的研究员，夜影。
“终于找到你了，星海博士。”夜影嘴角勾起一抹冷笑，“我们找你的探测仪很久了，只要有了你的数据，我们就能顺利唤醒哲尔尼亚斯，让卡洛斯地区迎来新的‘进化’。”
“你们所谓的进化，就是破坏生态平衡，伤害宝可梦吗？”星海愤怒地说道，“我绝对不会让你们得逞的！沙奈朵，准备战斗！”
沙奈朵立刻挡在星海身前，双手凝聚出超能力。夜影却不以为意，他拿出五个精灵球，扔了出去：“出来吧，大针蜂、毒刺水母、超音蝠、阿柏怪、耿鬼！给我把他们的宝可梦都抓起来！”
五只宝可梦从精灵球里出来，对着小智一行人发起了攻击。小智立刻喊道：“皮卡丘，使用‘十万伏特’！呱呱泡蛙，用‘水炮’！”
皮卡丘释放出十万伏特，击中了超音蝠，超音蝠瞬间失去了战斗能力。呱呱泡蛙的水炮则击中了毒刺水母，毒刺水母的身体晃了晃，却没有倒下——它的防御力比想象中更强。