暗星文明的救援战结束后，联盟展开了为期一个月的全面排查，确保多元宇宙中不再有虚空教团的残余势力。侦查部队深入各个边缘宇宙和时空夹缝，对所有疑似据点进行清理，最终确认，虚空教团的所有成员已被彻底消灭，这场持续已久的多元宇宙战争，终于迎来了最后的收尾之战 —— 肃清虚空教团在多元宇宙中留下的所有隐患。
这些隐患包括：散布在各个星球的虚空能量污染源、隐藏在地下的虚空武器库、被虚空能量感染的野生动物、以及部分尚未完全净化的虚空教团实验基地。张川将这些隐患分为四类，组建了四支专项清剿部队，分别负责处理不同类型的隐患。
第一支 “污染净化部队” 由圣光宇宙和绿野族组成，共五百人，配备了先进的净化设备和生命之泉，前往各个受污染的星球，对虚空能量污染源进行净化。在 “黑死星”—— 一颗被虚空教团用作实验基地的星球，污染浓度极高，地表覆盖着黑色的虚空苔藓，空气中弥漫着刺鼻的毒素，大量的野生动物被感染，变得狂暴嗜血。
净化部队抵达后，圣光法师释放全域圣光，金色的圣光能量如同细雨般洒落，净化着空气中的毒素；绿野族的灵植医师种植净化灵树和净化灵藤，吸收土壤中的虚空能量；同时，部队中的战斗人员负责清理被感染的野生动物。这些野生动物体型庞大，皮肤坚硬，牙齿锋利，而且具有很强的攻击性，净化部队付出了十余人牺牲的代价，才将其全部清理。经过十天的努力，黑死星的污染被彻底清除，星球逐渐恢复了生机。
第二支 “武器销毁部队” 由机械宇宙和灵曜星组成，共三百人，负责寻找和销毁虚空教团的隐藏武器库。在 “暗月星球” 的地下深处，部队发现了一座巨大的武器库，里面存放着大量的虚空能量炮、虚空炸弹、污染药剂等武器，数量足以装备一支万人部队。武器库的防御极为严密，布满了虚空符文陷阱和自动防御系统，部队在破解陷阱的过程中，有五名战士不幸牺牲。最终，部队成功进入武器库，将所有武器全部销毁，避免了这些危险武器流入其他势力手中。
第三支 “实验基地清剿部队” 由暗影族和时空守护者组成，共两百人，负责清剿虚空教团的实验基地。在 “遗忘星域” 的一座废弃空间站中，部队发现了最后一座虚空教团的实验基地，基地中残留着大量的实验数据和实验体残骸，这些实验体是虚空教团用不同文明的生物改造而成，具有强大的战斗力和腐蚀性。
清剿部队潜入基地后，与基地中残留的实验体展开了激烈战斗。这些实验体没有意识，只会疯狂攻击，而且能够吸收虚空能量快速愈合，清剿部队的战士们费了九牛二虎之力，才将其全部消灭。随后，部队销毁了所有的实验数据，炸毁了实验基地，彻底杜绝了虚空教团的实验技术流传。
第四支 “残余监测部队” 由复仇者联盟和联盟总部的科研人员组成，共一百人，负责在多元宇宙的各个关键节点布置监测设备，建立长期的虚空能量监测网络，确保一旦有新的虚空能量波动出现，能够及时发现并处理。监测部队在多元宇宙壁垒的边缘、各个文明的母星附近、以及之前的虚空教团活跃区域，共布置了五千个监测设备，形成了一张全方位的监测网。
在清剿隐患的过程中，联盟部队再次遭遇了小规模的抵抗。在一座隐藏的虚空教团补给站中，部队遇到了十余名留守的虚空战士，他们宁死不降，与部队展开了殊死搏斗。这些战士都是虚空教团的死忠分子，战斗力极强，而且熟悉补给站的环境，部队付出了二十余人伤亡的代价，才将其全部消灭。
当最后一座实验基地被炸毁，最后一个监测设备布置完毕，多元宇宙中的所有虚空教团隐患被彻底清除。联盟在元初文明母星举行了盛大的庆功仪式，各个文明的代表齐聚一堂，共同庆祝这场来之不易的胜利。
庆功仪式的高台上，张川站在中央，看着台下欢呼的人群，心中充满了感慨。这场战争，联盟付出了巨大的代价：战舰损失超过两千艘，机甲损失五千余台，战士牺牲超过十万余人，无数的家庭失去了亲人，无数的星球遭到了破坏。但最终，联盟赢得了胜利，粉碎了虚空教团的阴谋，守护了多元宇宙的和平与自由。
“各位盟友，各位战士们！” 张川的声音通过扩音系统传遍整个广场，“今天，我们终于彻底肃清了虚空教团的所有势力，赢得了这场战争的最终胜利！这场胜利，属于每一位为和平而战的战士，属于每一个坚守正义的文明！”
他向牺牲的战士们致敬：“让我们永远铭记那些为了和平而牺牲的英雄们，他们的英名将永远铭刻在多元宇宙的历史丰碑上，他们的精神将永远激励着我们！”
广场上的人群齐声欢呼，掌声和欢呼声经久不息。各个文明的代表纷纷上台发言，表达对联盟的感谢和对未来的期许。他们承诺，将永远团结在多元宇宙自由联盟的旗帜下，共同守护多元宇宙的和平，促进文明之间的交流与合作，让战争永远成为历史。
庆功仪式结束后，张川独自来到元初文明母星的观测台，望着璀璨的星河。星河依旧璀璨，但经历了战争的洗礼，每一颗星球都承载着伤痛与希望。苏婉儿、赵灵儿、雷克斯、莫尔等核心伙伴走到他身边，与他并肩站在观测台。
“张川，战争结束了，我们终于可以休息了。” 苏婉儿的声音温柔而欣慰。
张川点了点头，脸上露出了久违的笑容：“是啊，战争结束了。但我们的使命还没有结束，未来，我们还要守护这份和平，让多元宇宙的每一个文明都能自由发展，繁荣昌盛。”
他看向远处的星河，眼中闪烁着对未来的期待。这场血染星河的战争，不仅粉碎了邪恶的阴谋，更让多元宇宙的各个文明团结在了一起。一个新的时代已经到来，和平与繁荣的种子已经在多元宇宙的每一个角落生根发芽，而张川和他的伙伴们，将继续作为多元宇宙的守护者，书写属于和平与自由的新篇章。