《西行医鉴》初稿完成的消息，如同在平静的湖面投下石子，在长安的杏林（医学界）激荡起层层涟漪。阿树依循前议，请李仁溥及几位交好的太医署博士帮忙，将书稿中“方”、“药”及部分“法”的章节，精心抄录了十数份，分送太医署、尚药局及各坊有名望且思想较为开明的医家，附上书信，恳请“同道斧正，不吝赐教”。
起初，回应多是礼节性的客套，或仅限于对某些西域药材性味的询问。然而，随着时间推移，一些认真研读过书稿的医者，开始带着思索与质疑，亲自登门造访济世堂。
首先发难的，是太医署一位专精《伤寒》的吴博士。他指着书稿中一段关于“热病初起，邪在膜原”的论述，以及对应的、融合了达原饮与天竺苦寒药的方剂，诘问道：“阿树先生，仲景先师立六经辨证，纲举目张。邪犯太阳、阳明、少阳……层次井然。您这‘邪伏膜原’之说，源于《瘟疫论》，尚可理解。然则混杂天竺苦寒之品，其性峻烈，岂不虑其引邪深入，伐伤脾胃阳气？恐与仲景‘保胃气、存津液’之训相悖！”
阿树早有准备，他请吴博士落座，命平安奉上清茶，然后不疾不徐地回应：“吴公深研《伤寒》，晚辈敬佩。仲景之学，确为万世法程。然天地之气变异，疾病谱系亦随之而变。晚辈西行所见，尤其如‘驼瘟’、‘大漠热毒’等戾气致病，其势凶猛，传变迅速，往往初起即见表里俱热、气营两燔之象，非单纯六经传变所能尽括。此时邪热壅盛，犹如大火燎原，若不用重剂，兼以透达膜原、清解戾气之药，恐杯水车薪，贻误病机。晚辈所用天竺苦药，正是取其气雄力猛，直折火势，然必佐以中原护胃之品，如甘草、大枣，或于方后嘱以米粥调养，正是遵循‘祛邪勿伤正’之旨，与仲景训诫，实无二致。”
他随即列举了在凉州、西域治愈的多个重症热病案例，详细说明当时病证、用药思路与转归。吴博士听着，眉头时而紧锁，时而舒展，最终叹道：“先生以实例为证，倒让老夫难以驳斥。只是……这用药之道，实在险峻，非经验老到者，不可轻试。”
阿树肃然道：“吴公所言极是。故晚辈在书中反复强调，需辨证精确，胆大心细，更需视患者体质强弱而定。绝非教人孟浪施用。”
一波未平，一波又起。一位擅长疮疡外科的刘姓医官，对“术”篇中所载的“金针拔障”与“剖腹排脓”等法大为震惊，直言此非医道，近乎“屠沽之术”，且风险极大，易致谤议。
阿树并未直接反驳，而是请这位刘医官观摩了一例他为一位眼生“圆翳内障”的老者施行的“金针拔障术”。手术在济世堂特设的净室中进行，阿树凝神静气，手法稳准轻快，平安熟练配合。不过一刻钟，混浊的晶状体已被拨离原位。数日后，老者重见光明，喜极而泣，亲自到刘医官府上道谢。
亲眼目睹奇迹，刘医官态度大为转变，转而向阿树请教手术要点与预防“破伤风”（他们称之为“金疮痉”）之法。阿树倾囊相授，并将改进后的器械图样与之分享。
当然，并非所有质疑都能轻易化解。一些根深蒂固的观念，非一日可改。有医者认为西域理论“怪力乱神”，不屑一顾；有药商质疑西域药材来源，恐其“性味不驯”；更有甚者，私下议论阿树师徒“标新立异”、“以夷变夏”。
面对这些，阿树始终保持着超然与耐心。他对平安说：“学问之争，自古有之。我辈只需立定‘救济众生’之根本，以疗效实证说话，假以时日，是非自有公论。”
与此同时，支持与共鸣的声音也在悄然增长。太医署几位年轻博士，对阿树融合东西的诊断方法尤为感兴趣，常来请教吐蕃尿诊、波斯脉诊的细节。一位专攻妇儿的孙姓女医，对阿树从波斯带回的、用于促进伤口愈合的“玫瑰纯露”及天竺的儿科护理法十分推崇，开始在自家医馆尝试使用，效果颇佳，遂成为阿树的坚定支持者。
平安也逐渐在年轻一代医者中树立起声望。他主持的“西域药材辨识与临床应用”小聚，吸引了众多好奇的学徒和年轻大夫。他不仅讲解药性，还常常分享西行路上的见闻，将枯燥的药理融入生动的故事中，引人入胜。他编纂的《西域药草辑要》小册，虽不及《西行医鉴》宏富，却因简明实用，在坊间医者中悄悄流传。
这年秋冬之交，长安城中忽有一种“咳喘疫”流行，患者多为老幼，咳嗽剧烈，喘促难卧，发热不高却缠绵难愈。常规的宣肺止咳方药效果不佳。
阿树观察疫情，发现此症似与常见风寒咳嗽不同，其咳声紧促，痰黏难出，舌苔多腻，脉象濡数，兼有胸脘痞闷之感。他想起在天竺与波斯都曾见过类似症候，当地医者多认为与湿热或痰浊蕴肺有关。
他大胆提出新论，认为此乃“湿浊挟热，痹阻肺络”，治疗当以“宣肺化湿，清热涤痰”为主。他拟定新方，以麻杏石甘汤宣肺清热为基础，加入天竺化痰的“鸭嘴花”、波斯燥湿的“阿魏”（极小量），更仿照天竺药油按摩之法，以薄荷油、桉叶油等擦拭胸背，以助宣通肺气。
此法初行，争议更大。然而，济世堂接诊的此类患者，按此调治后，咳喘症状缓解速度明显快于他处。消息逐渐传开，一些束手无策的医家和病患，开始尝试采纳阿树之法。虽非尽愈，但有效率显着提高，使得阿树“融合医学”的声音，在实践的检验中，又增添了几分底气。
经过近一年的争论、验证与沉淀，《西行医鉴》及其所代表的医学思想，终于在长安杏林扎下根来，虽非主流，却已是一股不可忽视的“新声”。阿树知道，着书立说并非终点，让其中的智慧真正融入日常诊疗，惠及千家万户，才是终极目标。
这一日，大雪初霁，天地澄澈。一位来自江南的年轻医者，慕名远道而来，欲拜入阿树门下，学习这融汇东西的医道。阿树看着堂下恭敬执弟子礼的年轻人，又望向身边已然能够独当一面的平安，心中感慨万千。
他对平安道：“你看，薪火已开始传递。我等之路，不孤矣。”
平安颔首，眼中闪烁着与师父一样的坚定光芒。杏林新声，已随长安之风，悄然远扬。而传承与发扬的重任，正悄然落在新一代的肩上。